A série apresenta um panorama de alguns eventos centrais do universo da política brasileira dos últimos anos, como a promulgação da Constituição de 1988, o julgamento do Mensalão e a Operação Lava-Jato, para abordar o fenômeno da crescente participação do poder Judiciário na configuração atual do poder no país.

República dos Juízes traça paralelos históricos e análises conjunturais por meio de uma rica diversidade de depoimentos de especialistas, reportagens, registros históricos e outros materiais de arquivo para interpretar o presente e indicar possíveis perspectivas para o futuro. O projeto também foi lançado em uma versão longa-metragem, com duração de 100 minutos.